Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lig1P37913 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lig1P37913 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lig1P37913 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lig1P37913 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lig1P37913 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lig1P37913 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lig1P37913 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lig1P37913 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lig1P37913 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lig1P37913 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lig1P37913 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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