Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpargP37238 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpargP37238 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpargP37238 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpargP37238 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PpargP37238 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PpargP37238 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PpargP37238 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PpargP37238 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms