Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PpardP35396 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PpardP35396 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PpardP35396 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PpardP35396 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PpardP35396 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PpardP35396 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PpardP35396 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PpardP35396 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms