Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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