Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pabpc1P29341 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms