Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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