Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms