Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkchP23298 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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