Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P20040 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P20040 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P20040 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
P20040 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P20040 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P20040 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P20040 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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