Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NefhP19246 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NefhP19246 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms