Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms