Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Surf1P09925 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Surf1P09925 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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