Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
TtrP07309 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
TtrP07309 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
TtrP07309 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms