Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms