Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P01649 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P01649 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P01649 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P01649 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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P01649 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01649 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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