Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01648 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01648 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01648 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms