Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01644 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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P01644 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01644 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01644 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms