Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms