Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms