Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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