Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms