Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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