Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms