Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Efnb3O35393 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Efnb3O35393 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Efnb3O35393 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb3O35393 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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