Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Degs1O09005 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms