Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hps1O08983 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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