Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm8888J3QPX5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm8888J3QPX5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm8888J3QPX5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm8888J3QPX5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm8888J3QPX5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8888J3QPX5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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