Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm21818J3KMS6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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