Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21411J3KMS0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms