Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm17535J3KMR8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17535J3KMR8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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