Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms