Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8005F6YKY3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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