Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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