Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3250E9Q1M3 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms