Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms