Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms