Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms