Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms