Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc6D3YZP9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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