Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms