Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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