Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms