Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf518bB2RRE4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Znf518bB2RRE4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Znf518bB2RRE4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Znf518bB2RRE4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Znf518bB2RRE4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Znf518bB2RRE4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Znf518bB2RRE4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Znf518bB2RRE4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Znf518bB2RRE4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Znf518bB2RRE4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf518bB2RRE4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms