Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms