Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms