Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms