Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms