Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spocd1B1ASB6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms