Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms