Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms